基础医学实验教学中心现有解剖实验室、显微镜室、互动显微镜室、荧光显微镜室、生物化学实验室、BL-420N生物机能实验室、动物实验室、计算机仿真实验室、胚胎学标本模型室、大体标本陈列室、教学切片准备室、高压消毒室、精密教学仪器室等用于本科实验教学的实验场所71间，4536.4平方米。