中心有完善的规章制度，实验室日常管理（仪器设备维护、元器件管理、实验环境维护、实验准备、实验指导、开放实验值班、指导等）责任到人，职责明确；实验教学管理（实验内容选择，实验方式确定，实验课程安排，实验项目研发，实验教材编写，实验课件制作，网上实验资源编写等）以课程组为单位组织。中心监控系统，可远程登录，同时学校保卫处、网络中心均设置了监控，为实验室安全运行提供了保障。
